Per deelbekken komt er een deelbekkenbeheerplan met concrete oplossingen voor lokale waterproblemen. Het plan beschrijft in detail de knelpunten en mogelijkheden, de doelstellingen, de te nemen acties en maatregelen, de middelen en de voorziene termijn. Het Vlaams Gewest, de provincie(s), de gemeenten en de polders & wateringen op wiens grondgebied het deelbekken gelegen is, zullen samenwerken in 'waterschappen' om het plan op te stellen. De provincie is hierbij verantwoordelijk voor de coördinatie.