Inwendig beheer is het beheer dat op het terrein zelf wordt gevoerd, zoals maaien, plaggen, begrazen... Daarnaast is er nog het uitwendig beheer. Dit is het beschermen van natuurgebieden tegen nadelige invloeden van buitenaf, bijvoorbeeld voorkomen dat vervuild water of erg voedselrijk water uit intensieve landbouwgebieden het natuurgebied instroomt.